Анатолий Клёсов - ДНК-генеалогия от А до Т
9
Mendez, F.L., Krahn, Т., Schrack, В., Krahn, А.-М., Veeramah, K.R., Woerner, A.E., Fomine, F.L.M., Bradman, N., Thomas, M.G., Karafet, T.M., Hammer, M.F. (2013) An African American paternal lineage adds an extremely ancient root to the human у chromosome phylogenetic tree. Am. J. Hum. Genet. 92,454–459.
10
http://www.lebialem.info/
11
Однонули – это носители гаплогруппы A0, африканской по нынешнему месту жительства. Где эта гаплогруппа образовалась – пока неизвестно. Датировка по гаплотипам дает ее «возраст» 180 тысяч лет, датировка по снипам не дана, видимо, потому, что данных пока мало. Мы приводим это здесь только для того, чтобы показать, насколько передним краем науки это сейчас является, и как много здесь пока неясностей. Но датировка по гаплотипам 180 тысяч лет для времени образования гаплогруппы A0 более надежна, во всяком случае пока.
В любом случае, гаплогруппы A00 и A0 пока являются древнейшими, и образовались до расхождения эволюционного (Y-хромосома) дерева человечества на африканскую и неафриканскую ветви. Нам этого для концептуальных рассмотрений ДНК-генеалогии человечества пока достаточно.
Однонулей, то есть носителей гаплогруппы A0, найдено в мире всего полтора десятка человек. Они рассеяны парами и тройками по субкладам A0,
12
https://www.familytreedna.com/public/Haplogroup_A/default. aspx?section=yresults
13
Scozzari, R., Massaia, A., DAtanasio, Е., Myres, N.M., Perego, U.A., Trombetta, В., & Cruciani, F. (2012) Molecular dissection of the basal clades in the human Y chromosome phylogenetic tree. PLoS ONE, 7, Article ID: e49170. http://dx.doi.org/10.1371/journal
14
Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80-86
15
http://www.scirp.org/journal/HottestPaper.aspx?JournalID=737
16
Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80–86.
17
Клёсов, А.А., Килин, В.В. (2015) Калькулятор Килина-Клёсова для расчета времен до общих предков (TMRCA): новое издание. Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 321–375.
18
http://dna-academy.ruAilin-klyosov/
19
Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80-86
20
Klyosov, A.A., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80–86.
21
Юрковец, В.П. (2015) Климатическая катастрофа гаплогруппы «Бета». Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 376–432.
22
Юрковец, В.П. (2015) Климатическая катастрофа гаплогруппы «Бета». Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 376–432.
23
Groucutt, H.S., Petraglia, M.D., Bailey, G., Scerri, E.M., Parton, A., Clark-Balzan, L., Jennings, R.P., Lewis, L., Blinkhorn, J., Drake, N.A., Breeze, P.S., Inglis, R.H., Deves, M.H., Meredith-Williams, M., Boivin, N., Thomas, M.G., Scally, A. (2015) Rethinking the dispersal of Homo sapiens our of Africa. Evolutionary Anhropology, 24,149–164.
24
Behar, D.M., van Oven, M., Rosset, S., Metspalu, M., 100gvali, E.L., Silva, N.M., Kivisild, T., Torroni, A., Villems, R. (2012) A “Copernican” reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Amer. J. Human Genet. 90,675–684.
25
Groucutt, H.S., Petraglia, M.D., Bailey, G., Scerri, E.M., Parton, A., Clark-Balzan, L., Jennings, R.P., Lewis, L., Blinkhorn, J., Drake, N.A., Breeze, P.S., Inglis, R.H., Deves, M.H., Meredith-Williams, M., Boivin, N., Thomas, M.G., Scally, A. (2015) Rethinking the dispersal of Homo sapiens our of Africa. Evolutionary Anhropology, 24,149–164.
26
Behar, D.M., van Oven, М., Rosset, S., Metspalu, M., 100gvali, E.L., Silva, N.M., Kivisild, T., Torroni, A., Villems, R. (2012) A “Copernican” reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Amer. J. Human Genet. 90, 675–684.
27
http://www.yfull.eom/tree/B/
28
https://www.familytreedna.com/public/BYDNA/default. aspx?section=yresults
29
Клёсов, А.А., Саидов, Х.С. (2015) Евреи и пуштуны Афганистана. Концептуал, М., стр. 441–443.
30
http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpB.html
31
Barbieri, С., H ± 1bner, A., Macholdt, Е., Ni, S., Lippold, S., Schröder, R., Mpoloka, S.W., Purps, J., Roewer, L., Stoneking, M., Pakendorf, B. (2015) Refining the Y chromosome phylogeny with southern African sequences. bioRxiv, doi: http;dx.doi.org/10.1101/034983.
32
Barbieri, С., H ± 1bner, A., Macholdt, Е., Ni, S., Lippold, S., Schröder, R., Mpoloka, S.W., Purps, J., Roewer, L., Stoneking, M., Pakendorf, B. (2015) Refining the Y chromosome phylogeny with southern African sequences. bioRxiv, doi: http;dx.doi.org/10.1101/034983.
33
3 3. http://www.yfull. com/tree/С/
34
Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T.S., Sikora, M., Malaspinas, A.-S., Manica, A., Moltke, I., A1brechtsen, A., Ко, A., Margaryan, A., Moiseyev, V., Goebel, T., Westaway, M., Lambert, D., Khartanovich, V., Wall, J.D., Nigst, P.R., Foley, R.A., Lahr, M.M., Nielsen, R., Orlando, L., Willerslev, E. (2014) Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years. Supplementary Materials. Science, DOI: 10.1126/science.aaa0114
35
Nagle, N., Ballantyne, K.N., van Oven, M., Tyler-Smith, C., Xue, Y., Taylor, D., Wilcox, S., Wilcox, L., Turkalov, R., van Oorschot, R.A., McAllister, R, Williams, L., Kayser, M., Mitchell, R J. (2015) Antiquity and diversity of aboriginal Australian Y-chromosomes. Am. J. Phys. Anthropol. doi: 10.1002/ajpa.22886, October 30, 2015
36
Allentoft, М.Е., Sikora, М., Sjögren, K.G., Rasmussen, S., Rasmussen, M., Stenderup, J., Damgaard, P.B., Schroeder, H., Ahlström, T., Vinner, L., Malaspinas, A.S., Margaryan, A., Higham, T., Chivall, D., Lynnerup, N., Harvig, L, Baron, J., Della Casa, P., Dqbrowski, R, Duffy, P.R., Ebel, A.V., Epimakhov, A., Frei, К., Furmanek, M., Gralak, T.,et. al. (2015) Population genomics of Bronze Age Eurasia. Nature 522(7555), 167-72. doi: 10.1038/nature 14507.
37
Olalde, I., Allentoft, M.E., Sänchez-Ouinto, F., Santpere, G., Chiang, C.W.K., DeGiorgio, M., Prado-Martinez, J… Rodriguez, J.A., Rasmussen, S., Ouilez, J., Ramirez, O., Marigorta, U.M., Fernändez-Callejo, M., Prada, M.E., Encinas, J.M.V., Nielsen, R., Netea, M.G., Novembre, J., Sturm, R.A., Sabeti, R, Marques-Bonet, T., Navarro, A., Willerslev, E., Lalueza-Fox, C. (2014) Derived immune and ancestral pigmentation alleles in a 7,000-year-old Mesolithic European. Nature 507, 225–228.
38
Gamba, С., Jones, E.R., Teasdale, M.D., McLaughlin, R.L., Gonzalez-Fortes, G., Mattiangeli, V., Domboroczki, L., Kovari, I., Pap, I., Anders, A., Whittle, A. Dani, J., Raczky, P., Higham, T.F.G., Hofreiter, M., Bradley, D.G., Pinhasi, R. (2014) Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory. Nature Communs, DOI: 10.1038/ncomms6257
39
https://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default. aspx?section=yresults
40
Klyosov, А.А. (2009) DNA Genealogy, mutation rates, and some historical evidences written in Y-chromosome. I. Basic principles and the method. J. Genetic Genealogy, 5,186–216.
41
Klyosov, A. A. (2012) Ancient history of the Arbins, bearers of haplogroup R1b, from Central Asia to Europe, 16,000 to 1500 years before present. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 87-105.
42
Адамов, Д.С., Клёсов, А.А. (2009) Определение возраста популяций по STR гаплотипам Y-хромосомы. Часть II. Погрешности расчетов. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, т. 2, № 1, стр. 93-103; Адамов, Д.С., Клёсов, А.А. (2009) Определение возраста популяций по STR гаплотипам Y-хромосомы. Часть III. Примеры «линейных» и «квадратичных» моделей с учетом степени асимметрии мутаций. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, т. 2, № 2, стр. 187–199; Klyosov, А.А. (2009) DNA Genealogy, mutation rates, and some historical evidences written in Y-chromosome. I. Basic principles and the method. J. Genetic Genealogy, 5,186–216; Klyosov, A.A. (2012) Ancient history of the Arbins, bearers of haplogroup R1b, from Central Asia to Europe, 16,000 to 1500 years before present. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 87-105
43
Nagle, N., Ballantyne, K.N., van Oven, M., Tyler-Smith, C., Xue, Y., Taylor, D., Wilcox, S., Wilcox, L., Turkalov, R., van Oorschot, R.A., McAllister, R, Williams, L., Kayser, M., Mitchell, R J. (2015) Antiquity and diversity of aboriginal Australian Y-chromosomes. Am. J. Phys. Anthropol. doi: 10.1002/ajpa.22886, October 30, 2015
44
https://www.familytreedna.com/public/kirgiz/default. aspx?section=yresults
45
Zerjal, Т., Xue, Y., Bertorelle, G., Wells, R.S., Bao, W. et al. (2003) The Genetic Legacy of the Mongols. Am. J. Hum. Genet. 72, 717–721.
46
Там же.
47
https://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default. aspx?section=yresults
48
https://www.familytreedna.com/public/Dhaplogroup?iframe=yresults
49
http://www.yfull. com/tree/D/
50
5 0. http://www.yfull. com/tree/Е/
51
Lacan, М., Keyser, C., Ricaut, F.-X. et al. (2011) Ancient DNA suggests the leading role played by men in the Neolithic dissemination. Proc. Natl. Acad. Sei. US, 108,18255-18259.
52
https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults
53
http://www.yfull.eom/tree/E/
54
Discussions. The mutation rate constants in DNA genealogy and related issues. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, том 4, № 11, 2108–2195 (2011).
55
https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults
56
https://www.familytreedna.com/public/E-V13/default. aspx?section=yresults
57
Haak, W., Lazaridis, I., Patterson, N., Rohland, N., Mallick, S., Llamas, В., Brandt, G., Nordenfeit, S., Harney, E., Stewardson, K., Fu, O., Mittnik, A., Bänf-fy, E., Economou, C., Francken, M., Friederich, S., Pena, R.G., Hallgren, F., Khar-tanovich, V., Khokhlov, A., Kunst, M., Kuznetsov, P., Meller, H., Mochalov, 0., Moiseyev, V., Nicklisch, N., Pichler, S.L., Risch, R., Guerra, M.A.R, Roth, C., Szec-senyi-Nagy, A., Wahl, J., Meyer, M., Krause, J., Brown, D., Anthony, D., Cooper, A., Alt, K.W., Reich, D. (2015) Massive migration from the steppe is a source for Indo-European languages in Europe. Nature 522, 207–211.
58
Roewer, L., Willuweit, S., Kr ± 1ger, C., Nagy, M., Rychkov, S., Morozowa, L, Naumova, O., Schneider,Y., Zhukova, O., Stoneking, M., Nasidze, I. (2008) Analysis of Y chromosome STR haplotypes in the European part of Russia reveals high diversities but non-significant genetic distances between populations. Int J Legal Med., 122,219–223.
59
Balanovsky, О., Dibirova, К., Dybo, A., Mudrak, О., Frolova, S., Pocheshkhova, Е., Haber, М., Platt, D., Schurr, T., Haak, W., Kuznetsova, M., Radzhabov, M., Balaganskaya, O., Romanov, A., Zakharova, T., Hernanz S.D.F., Zalloua, R, Koshel, S., Ruhlen, M., Renfrew. C., Wells, R.S., Tyler-Smith, C., Balanovska, E. (2011) Parallel evolution of genes and languages in the Caucasus region. Mol Biol Evol. 28, 2905–2920.
