Александр Марков - Рождение сложности. Эволюционная биология сегодня: неожиданные открытия и новые вопросы
промотор — участок ДНК, к которому прикрепляется фермент РНК-полимераза перед началом транскрипции. Промотор входит в состав «регуляторной области» гена. Ген без промотора не может быть «считан» (транскрибирован). От свойств промотора зависит, как и когда будет работать ген. Стр. 382.
простейшие — то же, что протисты.
протисты — общее наименование всех одноклеточных эукарот.
псевдогены — неработающие гены, вышедшие из строя в результате мутаций или изначально «молчащие» (например, ретропсевдогены, образовавшиеся в результате деятельности обратной транскриптазы и не имеющие промотора). Стр. 390, 455.
пунктуалистическая эволюция — идущая по принципу «прерывистого равновесия». Длительные периоды относительной стабильности вида чередуются с краткими периодами быстрых изменений. См. раздел «Постепенно или скачками?» в главе 6, стр. 357.
рекомбинация — обмен участками между молекулами ДНК (или РНК). Стр. 157, 377, 387, 405, 432.
репарация — «починка» ДНК, исправление всевозможных ошибок (мутаций, разрывов), возникающих в молекуле ДНК в силу различных причин. Репарация осуществляется специальными ферментами. Глава 9, стр. 502–504.
репликация — удвоение, размножение, копирование. Обычно термин применяется к процессу копирования молекул ДНК. В результате репликации из одной двухцепочечной молекулы ДНК («двойной спирали») получаются две точно такие же. Иногда в процессе репликации происходят ошибки — мутации. Глава 7, стр. 375.
репродуктивная изоляция — невозможность (или ограниченная возможность) представителей двух разных групп организмов скрещиваться между собой и (или) давать плодовитое потомство. Репродуктивная изоляция считается одним из важных критериев вида. Если представители двух группировок (популяций) не скрещиваются между собой, то это, скорее всего, разные виды. Если они делают это часто и охотно и производят полноценное потомство — значит, они относятся к одному и тому же виду. Впрочем, нельзя абсолютизировать этот критерий.
ретровирусы — группа РНК-содержащих вирусов, которые при помощи механизма обратной транскрипции встраивают копию своего генома в геном хозяйской клетки и размножаются вместе с ним. Родственны ретротранспозонам. Стр. 441–442.
ретропсевдоген — участок ДНК с последовательностью нуклеотидов, идентичной кодирующей части какого-нибудь гена, обычно неактивный, неработающий, который возник в результате деятельности обратной транскриптазы. Глава 8, стр. 455.
ретротранспозон — мобильный генетический элемент, размножающийся при помощи обратной транскрипции. Глава 8, сюжет «Вирусы и мобильные элементы: кто от кого произошел».
рецептор — белок, который избирательно распознает определенное вещество (называемое лигандом), связывается с ним и тем или иным способом «сообщает» о случившемся другим белкам или клеткам. Обычно рецепторные белки располагаются на клеточной мембране, пронизывая ее насквозь. Снаружи от мембраны находится рецепторная часть белковой молекулы. Если она «поймает» лиганд, это приводит к изменению структуры той части молекулы, которая находится по другую сторону мембраны — в цитоплазме. По этому изменению клетка «узнает», что химический сигнал получен. Глава 9, раздел «Взаимное узнавание».
рибозим — молекула РНК с каталитической (ферментативной) функцией, способная осуществлять активную «работу» в клетке. Стр. 58.
рибосома — молекулярная «машинка» для трансляции (синтеза белка на матрице мРНК). Состоит из рРНК и рибосомных белков. Стр. 70.
РНК — рибонуклеиновая кислота, биополимер, молекула которого представляет собой цепочку из множества последовательно соединенных рибонуклеотидов (см. врезку «РНК» в главе 1, стр. 56).
матричная (мРНК) — РНК, образующаяся в результате транскрипции (считывания гена). «Незрелая» мРНК содержит интроны и другие некодирующие фрагменты, которые затем удаляются в ходе сплайсинга. Стр. 75, 77.
транспортная (тРНК) — функциональная РНК (рибозим), играющая ключевую роль в «прочтении» генетического кода в ходе трансляции (синтеза белка). Подносит нужные аминокислоты к рибосоме, осуществляющей синтез белка. См.: Антикодон. Стр. 61.
рибосомная (рРНК) — функциональная РНК (рибозим), входящая в состав рибосом. Играет ключевую роль в процессе трансляции (синтеза белка). Стр. 59, 70.
РНК-полимераза — фермент, синтезирующий молекулу РНК на матрице. Матрицей может служить другая молекула РНК или ДНК. В первом случае говорят об РНК-зависимых РНК-полимеразах, во втором — о ДНК-зависимых. Глава 1, раздел «РНК обзаводится помощниками», стр. 70.
сайт связывания транскрипционного фактора — короткий участок ДНК, к которому может прикрепиться белок — транскрипционный фактор (ТФ). Сайты связывания ТФ находятся в регуляторных областях генов. Разные ТФ имеют разные сайты связывания. Степень специфичности варьируется: одни ТФ прикрепляются только к строго определенной последовательности нуклеотидов, другие довольствуются расплывчатым «мотивом», в котором только некоторые нуклеотиды являются ключевыми. Глава 8, раздел «Вирусы и мобильные генетические элементы», стр. 438.
секвенирование — экспериментальное определение последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК или РНК.
симпатрическое видообразование — разделение исходного вида на два (или более) при обитании на одной и той же территории без физических изолирующих барьеров. См. сюжет «Эволюция на островах идет параллельными путями» в главе 6, стр. 335.
синапс, синаптический контакт — специализированная зона контакта между отростками нервных клеток и другими клетками, нервными, мышечными или иными, обеспечивающая передачу информационного сигнала.
синтетическая теория эволюции (СТЭ) — система эволюционных взглядов, оформившаяся в середине XX века в результате синтеза дарвиновских идей и достижений генетики. Представляет собой важный этап развития эволюционного учения. Некоторые генетические и эволюционные закономерности приобрели в СТЭ характер «нерушимых догм», что потребовало в дальнейшем внесения многочисленных изменений и уточнений в теорию. «Развенчанию» этих догм посвящены многие разделы данной книги. Стр. 16.
сома — «вегетативная» часть организма, которая при размножении обычно не передает свой наследственный материал потомству. Например, у животных «соматическими» являются все клетки, кроме половых. Однако при вегетативном размножении (например, у растений) сома передает свои гены потомству. См. также Герма. Глава 4, сюжет «Появлению многоклеточности мешают обманщики». Стр. 225.
сперматоцит — мужская половая клетка животных в период ее роста и созревания. Стр. 485.
сплайсинг — процесс посттранскрипционной обработки мРНК, в ходе которого происходит удаление интронов. В результате «незрелая» мРНК с интронами превращается в «зрелую» мРНК без интронов, которую уже можно использовать в качестве матрицы для синтеза белка (трансляции).
альтернативный сплайсинг — см. одноименную врезку в главе 9, стр. 491.
строматолиты — слоистые минеральные образования, формирующиеся в результате жизнедеятельности микробных сообществ. Стр. 90, 258.
сульфатредукторы — хемоавтотрофные бактерии, живущие за счет реакции восстановления сульфатов. Потребляют сульфаты и восстановитель (например, молекулярный водород), выделяют восстановленные соединения серы (например, сероводород). Стр. 108–116.
теломеры — концевые участки хромосом у эукариот. У прокариот хромосомы не линейные, а кольцевые, поэтому у них нет тело- мер. При каждой репликации теломеры укорачиваются, поэтому на определенных этапах жизненного цикла их приходится восстанавливать — достраивать при помощи специальных ферментов теломераз. Согласно одной из теорий, укорачивание теломер в течение жизни многоклеточного организма является причиной старения (так называемая «теломерная теория старения»). На самом деле, скорее всего, причины старения гораздо сложнее и разнообразнее. Стр. 154.
трансгенный (организм) — генетическая химера, организм, в геном которого были вставлены чужеродные гены. Например, инсулин для диабетиков сегодня производится в промышленных количествах трансгенными бактериями — кишечными палочками, которым пересадили человеческий ген инсулина. Стр. 400.
транскрипция — «считывание генетической информации», синтез РНК на матрице ДНК. Осуществляется ферментом ДНК-зависимой РНК-полимеразой. Полученная молекула РНК в дальнейшем может быть использована для синтеза белка (трансляции). Стр. 77.